从2003年11月17日至今，农业部实行行政审批综合办公已经两年有余。两年来，在农业部党组的高度重视和正确领导下，经过有关司局和直属单位的共同努力，行政审批综合办公取得了丰硕成果。截止到2005年12月31日，农业部行政审批综合办公大厅共受理行政许可申请29942件，已经办结21199件，按时办结率达99.8％。
　　行政许可是行政机关管理社会经济、政治、文化的一种重要的事前控制手段，多年来发挥了重要的作用。但是，行政许可过多、过滥，也导致了工作效率低下，社会成本增加，更为行政权力“寻租”提供了空间，成为滋生某些腐败问题的温床，严重影响了政府的公信度。
　　根据国务院行政审批制度改革的统一安排和部署，农业部在取消和调整行政审批项目的同时，提出了一个明确的改革思路，即行政审批制度改革决不仅仅是减少行政审批项目的数量，更重要的是要通过改革建立起结构合理、配置科学、程序严密、制约有效的权力运行机制。
　　针对过去行政许可工作中存在的程序不够规范、过程不够透明、时限不够明确和服务措施不够完善等问题，农业部党组果断决策，将实行行政审批综合办公作为深化行政审批制度改革、加强党风廉政建设的一项重要措施，以工作方式创新促进政府职能转变。农业部2003年第16次常务会议研究决定，成立农业部行政审批综合办公室，其主要职能是：大厅日常管理、信息系统维护、许可程序监管、许可信息发布和窗口服务指导；设立农业部行政审批综合办公大厅，统一受理和回复行政许可申请，做到行政许可“一个窗口对外”。
　　从运行两年多的情况看，实行行政审批综合办公，规范了许可行为，增加了许可透明度，提高了办事效率，增强了服务意识。
　　一是规范了许可行为，促进了依法行政。通过加强制度建设和丰富监督手段，工作人员依法行政的意识明显增强，综合办及承办司局能够认真贯彻行政许可法，严格遵守各项规章制度，密切配合，各司其职，做到了依法审批、照章办事，使行政许可工作逐步走上了制度化、规范化和法治化的轨道。
　　二是增加了许可透明度，有效预防了“暗箱操作”。利用行政许可网页公开规章制度、办事指南和许可决定，不仅方便申请人了解行政许可相关信息，而且使整个许可工作置于公众监督之下，有效预防了“暗箱操作”，在抑制不正之风、消除腐败现象、加强廉政建设方面发挥了积极作用。社会公众可以通过行政许可网页上的在线调查、电子留言板和电子留言信箱等栏目，对行政许可工作提出建议和意见，参与行政审批制度改革，行使对行政行为的监督权，实现了行政机关与社会公众的互联互动，增强了行政决策的科学化、民主化。
　　三是转变了工作作风，提高了办事效率。按照行政许可法的有关要求，对纳入综合办公的行政许可事项全部规定了办理时限。综合办和有关部门利用计算机网络系统对行政许可工作实行全程跟踪、督察督办，承办司局工作节奏明显加快，办事效率显著提高。
　　四是强化了服务意识，提高了队伍素质。实行综合办公，变申请人跑为机关工作人员跑，变无时限办理为限期办理，变被动接受咨询为主动提供服务，变申请材料的多次补充为一次性告知，机关工作人员责任意识、效率意识、服务意识明显增强。
　　将行政许可事项全部纳入综合办公，只是行政审批综合办公这项改革的第一步。下一步，我们将按照部党组关于进一步巩固和扩大综合办公成果的要求，进一步理顺工作关系，减少不必要的环节，探索开辟“农药许可绿色通道”，提高工作质量和效率；进一步完善综合办公信息系统，丰富网上服务功能，扩大网上申请和审批试点范围；进一步加强对综合办公大厅的管理，建立工作人员考核评议制度，不断提高综合办公大厅的服务质量和水平。